Бактерии у ребенка

Здравствуйте, Павел Андреевич! У ребенка с рождения обнаружены бактерии. На ножках были красный прыщики, сухость, поставили диагноз- атопический дерматит, дисбактериоз. Лечим, они снова появляются. Сейчас ребенку 10 месяцев. Сдали опять кал и опять: золотистый стафилококк 10*3, клебсиелла пневмания 10*7, e.coli лактозонегативные 10*6, энтерококки 10*8. Сдали снова анализ, потому что месяц держится температура до 37,4. Каждый день. Был заложен нос, будто в носоглотке что-то стояло, сопли не отсасывалось. Когда ложился ребёнок для кормления, закладывало, мешало кушать, дышать. Лечились "интестибактериофаг". Сейчас к нему бактерии устойчивы. А клебсиелла вообще не выводится. Ещё сдали мочу по Нечипоренко, лейкоциты 4000. Ведь могут бактерии так проявляется? Но сейчас ещё зуб лезет. Подскажите как быть...