Как пишут авторы работы, опубликованной в Nature Medicine, с ростом урбанизации растет и заболеваемость астмой. Также есть исследования, которые показывают, что у детей, выросших в селе, на ферме, риск стать астматиком ниже, чем у горожан. Возможная тому причина — специфическая, свойственная именно для ферм микробиота. Ученые из Финляндии провели исследование фермерской и городской микробиоты, выяснить, так ли это.
Они собрали образцы пыли в домах, жители которых участвовали в когортных исследованиях LUKAS1 и LUKAS2, нацеленных на выявление причин астмы. Пыль на анализы взяли в фермерских домах, где жило в общей сложности 197 детей в возрасте 2 месяцев, а также в пригородных таунхаусах, которые к сельским отнести нельзя — там жило всего 182 двухмесячных ребенка. Через шесть лет ученые посмотрели, у кого из почти 400 детей возникла астма, и сопоставили это с данными о микробиоте их жилищ.
Ученые сравнили метагеномы образцов пыли и нашли отличия между «сельскими» и «городскими» микробными сообществами. В данных о микробиоте в образцах деревенской пыли они идентифицировали характерный паттерн, который назвали FaRMI. Для FaRMI характерно преобладание микробов из отрядов Bacteroidales, Clostridiales, Lactobacillales, а также архей рода Methanobrevibacter, которые живут обычно в коровьем рубце. В пыли же городских домов преобладали стрептококки и стафилококки. Разница микробиотами была, но, в некоторых пригородных домах преобладала всё же микробиота, близкая к FaRMI.
Затем ученые сопоставили получившуюся у них «микробную карту» с медицинскими данными и выяснили, что чем больше микробиом из пыли похож на фермерский, тем меньше ребенок, живущий в ее окружении, рисковал стать астматиком. В среднем, у деревенских детей астма развивалась примерно вдвое реже, чем у детей из пригородов.
Ученые приложили свои данные по паттерну FaRMI к данным похожего исследования домашней пыли, которое проводили их коллеги из Германии и Швейцарии. Оказалось, что и там риск развития астмы обратно коррелировал со степенью близости домашнего микробиома к FaRMI — чем ближе, тем риск меньше.
На финальном этапе исследователи изучили кровь детей из исследований LUKAS1 и LUKAS2. Оказалось, что белые кровяные тельца у детей, в домах которых преобладала «фермерская» микробиота, выделяют меньше провоспалительных интерлейкинов при контакте с веществами из клеточной стенки бактерий. По видимому, их организм спокойнее относится к вторжениям микробов и отвечает не таким сильным воспалением, как организм горожан. Возможно, что именно это как-то связано со сниженным риском астмы.
Ученые отметили, что микробы, изобилующие в FaRMI, характерны в основном для крупного рогатого скота, тогда как микробы в городской пыли свойственны скорее для человека. Такие микроорганизмы легче проникают и поселяются в нашем организме. Возможно, и это тоже влияет на склонность к астме.
Так или иначе, исследование выявило обратную корреляцию между «деревенской» микробиотой в пыли и развитием астмы у детей, но почему именно микробный состав пыли связан с астмой, с определенностью сказать нельзя.
Читайте также:
