Сгустки слизи и неприятный резкий запах в кале грудничка

Добрый день! Уже более двух недель мучаемся с какашками ребёнка. Сейчас малышу 4,5 месяца, полностью на ГВ. С рождения очень беспокойный, колики с утра до ночи, постоянно плакал, но стул при этом был жёлтого цвета с непереваренными комочками и молочным запахом. Около двух недель назад я ела яблоко и он начал его смоктать с удовольствием, деснами отгрызткусочек. Через день я увидела этот кусочек яблока в кале, после этого начался кошмар! Стул сначала был жидкий, пенный и темно зеленый, затем стали выходить огромные сгустки и даже куски слизи, как желе. Поначалу она была прозрачная, затем меняли цвет от непрозрачной до жёлтой и даже коричневой. Температуры не было. Врач прописал смекту, симбитер (бактерии полезные) и интести бактериофаг и сдали анализ. Через пять дней в результатах была обнаружена клебсиэлла пневмонии оксиджена какая-то 10в5. Поменяли бактериофаг на клебсиэльный очищенный, пропили его еще 6 дней (5мл 3 р/д), продолжали пить симбитер и поменяли его на энтерожермину затем. В течение приёма лекарств огромные куски слизи ушли, стул стал уже не такой зелёный, но слизь присутствует всех цветов радуги, только уже не сгусками, а как линные волокна или просто перемешанная с какашками. При назначении фагов чувствительность к ним не проверялась. С началом этих проблем набор веса ребёнком прекратился, стоит на месте. Помогите, пожалуйста, какие можно сдать анализы, боюсь чтоб вдруг это не проблема в этой клебсиэлле, а не дай Бог, какие-то серьёзные проблемы с кишечником или желудком. Р.s. Ребенок стал заметно спркойнее, по сравнению с периодом от рождения до трех месяцев, бывают, конечно, периоды плача. И очень много выходит воздуха после кормления; так же бывают срыгивания уже намного позже кормления, стул жидкий. Спасибо!